Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT36O76013 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT36O76013 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT36O76013 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT36O76013 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT36O76013 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT36O76013 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT36O76013 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT36O76013 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT36O76013 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT36O76013 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT36O76013 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT36O76013 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT36O76013 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT36O76013 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT36O76013 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT36O76013 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT36O76013 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT36O76013 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT36O76013 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT36O76013 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT36O76013 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT36O76013 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT36O76013 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT36O76013 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT36O76013 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT36O76013 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT36O76013 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT36O76013 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT36O76013 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT36O76013 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT36O76013 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms