Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms