Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSVO60911 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSVO60911 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSVO60911 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSVO60911 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSVO60911 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSVO60911 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSVO60911 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSVO60911 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSVO60911 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSVO60911 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSVO60911 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSVO60911 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSVO60911 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms