Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF2O60811 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF2O60811 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF2O60811 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms