Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD2O60548 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms