Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL4O60488 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL4O60488 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms