Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAK2O60296 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRAK2O60296 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAK2O60296 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms