Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNIP3LO60238 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms