Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9BO43861 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms