Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR3O43731 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR3O43731 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR3O43731 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms