Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GATCO43716 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GATCO43716 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GATCO43716 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GATCO43716 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GATCO43716 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GATCO43716 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GATCO43716 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATCO43716 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATCO43716 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATCO43716 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATCO43716 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATCO43716 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATCO43716 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GATCO43716 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms