Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMINO43313 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATMINO43313 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATMINO43313 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATMINO43313 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATMINO43313 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATMINO43313 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATMINO43313 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMINO43313 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMINO43313 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMINO43313 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMINO43313 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATMINO43313 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATMINO43313 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATMINO43313 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATMINO43313 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATMINO43313 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATMINO43313 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMINO43313 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMINO43313 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMINO43313 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMINO43313 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMINO43313 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMINO43313 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMINO43313 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMINO43313 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMINO43313 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMINO43313 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMINO43313 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms