Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAPSS1O43252 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAPSS1O43252 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms