Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN9O14815 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN9O14815 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms