Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TXNDC9O14530 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms