Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
O00370 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
O00370 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
O00370 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
O00370 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
O00370 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
O00370 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
O00370 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
O00370 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
O00370 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
O00370 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
O00370 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
O00370 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
O00370 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
O00370 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
O00370 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
O00370 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
O00370 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
O00370 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
O00370 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
O00370 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
O00370 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
O00370 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
O00370 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
O00370 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
O00370 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
O00370 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
O00370 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
O00370 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
O00370 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
O00370 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms