Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD11O00231 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms