Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KTA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KTA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KTA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KTA2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KTA2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3KTA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KTA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KTA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KTA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KTA2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KTA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3KTA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3KTA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3KTA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3KTA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
J3KTA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KTA2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KTA2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3KTA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
J3KTA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
J3KTA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3KTA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KTA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KTA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KTA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3KTA2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms