Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMX2-CTNND1H3BSU7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms