Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNC9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BNC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNC9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms