Protein–RNA interactions for Protein: E9PAM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PAM4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PAM4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PAM4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PAM4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PAM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PAM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PAM4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PAM4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PAM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PAM4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PAM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PAM4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PAM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PAM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PAM4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PAM4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PAM4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PAM4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PAM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PAM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PAM4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PAM4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PAM4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PAM4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PAM4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PAM4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PAM4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PAM4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PAM4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PAM4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E9PAM4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PAM4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PAM4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PAM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PAM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PAM4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PAM4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms