Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DXG7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DXG7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DXG7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DXG7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DXG7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DXG7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DXG7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DXG7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DXG7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DXG7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DXG7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DXG7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DXG7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DXG7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DXG7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DXG7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4DXG7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4DXG7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4DXG7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4DXG7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DXG7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DXG7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DXG7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B4DXG7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms