Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DEV8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DEV8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DEV8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DEV8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DEV8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DEV8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DEV8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DEV8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DEV8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DEV8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DEV8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DEV8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DEV8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DEV8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DEV8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DEV8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DEV8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DEV8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B4DEV8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms