Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOBPA7XYQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
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