Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAC3D1A6NKF1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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