Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23AA6NH52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms