Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP2A4UGR9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP2A4UGR9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms