Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCHNA4D1U4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCHNA4D1U4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCHNA4D1U4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms