Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSAPA4D1B5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms