Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPED1A4D0V7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms