Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF27A3QJZ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms