Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA8A3KMH1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA8A3KMH1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms