Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPDC1A2A3K4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPDC1A2A3K4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPDC1A2A3K4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms