Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV7S3A2A0A539 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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