Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RRA0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0U1RRA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms