Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0U1RQJ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQJ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191 ms