Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms