Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TMED7Q9Y3B3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TMED7Q9Y3B3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TMED7Q9Y3B3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TMED7Q9Y3B3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TMED7Q9Y3B3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TMED7Q9Y3B3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TMED7Q9Y3B3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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