Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms