Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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RNF7Q9UBF6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RNF7Q9UBF6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RNF7Q9UBF6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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