Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP36Q9P275 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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