Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TMEM30AQ9NV96 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TMEM30AQ9NV96 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TMEM30AQ9NV96 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TMEM30AQ9NV96 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TMEM30AQ9NV96 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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