Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms