Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT82Q9NSB4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms