Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms