Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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