Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms