Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT17Q9BSW7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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