Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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