Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIN3AQ96ST3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms